Jedne noći Josip je žurno probudio Mariju jer joj je morao reći nešto važno. Upravo mu se u snu bio ukazao Jehovin anđeo i rekao mu: “Ustani, uzmi dijete i majku njegovu te bježi u Egipat i ostani ondje dok ti ne kažem da se vratiš, jer Herod će tražiti dijete da ga pogubi!” (Matej 2:13).

Tako su Josip i Marija sa svojim sinom noću pobjegli odande, i to u pravi čas jer je Herod saznao da su ga zvjezdoznanci izigrali. On im je bio rekao da se vrate k njemu i jave mu gdje je Isus, no oni su otišli iz zemlje. Zato je sada bio izvan sebe od bijesa. U silnoj želji da ubije Isusa izdao je zapovijed da se u Betlehemu i okolici pobiju svi dječaci od dvije godine naniže. Dob dječaka odredio je na temelju onoga što su mu ranije rekli zvjezdoznanci s istoka.

Ne znamo koliko je djece tada pobijeno, ali pokolj tih nevinih dječaka bio je doista stravičan zločin! Gorak plač i naricanje neutješnih majki bili su ispunjenje biblijskog proročanstva koje je zapisao Božji prorok Jeremija (Jeremija 31:15).

U međuvremenu su Josip i njegova obitelj prebjegli u Egipat i ondje se nastanili. Nakon nekog vremena Josipu se u snu ponovno ukazao Jehovin anđeo. “Ustani”, rekao mu je, “uzmi dijete i majku njegovu i pođi u zemlju izraelsku, jer su umrli oni koji su tražili dušu djetetovu!” (Matej 2:20). Josip je zaključio da se on i njegova obitelj mogu vratiti u svoju zemlju. Tako se ispunilo još jedno biblijsko proročanstvo — da će Božji Sin biti dozvan iz Egipta (Hošea 11:1).

 Josip se vjerojatno namjeravao vratiti u Judeju, možda u okolicu Betlehema, gdje su živjeli prije nego što su pobjegli u Egipat. Ali saznao je da Judejom umjesto Heroda vlada njegov zli sin Arhelaj, a i Bog ga je ponovno u snu upozorio na opasnost. Stoga je odlučio s obitelji otputovati na sjever i nastaniti se u galilejskom gradu Nazaretu. U tom je gradu, daleko od žarišta vjerskih zbivanja, odrastao Isus, čime se ispunilo još jedno proročanstvo: “Zvat će se Nazarećanin” (Matej 2:23).