耶和华见证人从1956年开始在吉尔吉斯斯坦（吉尔吉斯）传道，并于1998年正式登记为合法的宗教团体。虽然该国的耶和华见证人曾受到严重的宗教迫害，但近年来他们的权益日渐受到政府的保护。

2013年11月，最高法院的宪法法庭一致裁定吉尔吉斯斯坦的替代役相关法规违宪，并要求政府修改法规。吉尔吉斯斯坦境内的法院都采纳宪法法庭的判决。所以自2014年起，耶和华见证人男子就不再因拒绝入伍而遭到迫害。2015年6月29日，吉尔吉斯斯坦修改服役相关法规，使依良心拒服兵役者可以改服非军事性质的替代役。

最高法院的宪法法庭于2014年9月做出了一项对耶和华见证人有利的判决，保障了人民的宗教自由。宪法法庭判定，2008年实施的宗教法部分内容违宪。可是，宗教事务委员却无视法庭的判决，拒绝让该国南部的耶和华见证人团体注册，有些地方政府因此认为耶和华见证人的活动是违法的。不过，只要耶和华见证人向政府官员澄清误会，地方政府就通常会容许他们参与集会和向人传道。耶和华见证人希望政府可以全面落实宪法法庭的判决，并让吉尔吉斯斯坦南部的耶和华见证人团体可以获得合法注册。